Tulku Thondup cho biết (dựa theo tiểu sử thế kỷ mười bốn do Chödrak Zangpo viết) rằng Longchenpa đã sáng tác hơn 270 luận giải 23. Nyoshul Khen Rinpoche, dựa vào danh mục một phần mà chính Longchenpa đã lập tại Bumthang, đưa ra con số ấn tượng là 307 24. Có thể rằng phần lớn các tác phẩm này khá ngắn và được viết trong mười năm viễn xứ, nhưng không may bị thất lạc do một tai nạn trên đường sông khi trở lại Tây Tạng. Dù đây chỉ là một giả định hợp lý, không ai có thể không kinh ngạc trước số lượng tác phẩm đồ sộ của ngài, nhất là trong bối cảnh một cuộc đời ngắn ngủi và đầy biến cố như vậy.

Về các tác phẩm còn tồn tại, Tulku Thondup đã lập một danh mục hữu ích chia chúng thành năm nhóm (25). Nhóm đầu tiên là bộ sưu tập nổi tiếng nhất của Longchenpa, Thất Đại Bảo Tạng (The Seven Great Treasures, mDzod chen bdun):

• Bảo Tạng Như Ý Châu (The Precious Treasure That Is Like a Wish-Fulfilling Jewel, Yid bzhin rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Yếu Chỉ (The Precious Treasure of Pith Instructions, Man ngag rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Pháp Giới Tối Thượng (The Precious Treasure of the Ultimate Expanse, Chos dbyings rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Các Hệ Thống Quan Điểm (The Precious Treasure of Tenet Systems, Grub mtha’ rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Thừa Tối Thượng (The Precious Treasure of the Supreme Vehicle, Theg mchog rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Ngữ Nghĩa (The Precious Treasure of Words and Meanings, Tshig don rin po che’i mdzod)
• Bảo Tạng Tự Nhiên (The Precious Treasure of the Natural State, gNas lugs rin po che’i mdzod)

Ngoại trừ tác phẩm cuối cùng, tất cả các văn bản này đều được nhắc đến trong danh mục của Longchenpa, cho thấy rằng khi ngài lập danh mục, Bảo Tạng Tự Nhiên (The Precious Treasure of the Natural State) có thể vẫn chưa được viết. Hơn nữa, như Gene Smith đã chỉ ra, sáu tác phẩm còn lại được liệt kê riêng biệt trong danh mục, cho thấy rằng Thất Đại Bảo Tạng (The Seven Great Treasures) không phải là một đơn vị văn học mà chính Longchenpa đã thiết lập mà chỉ được tập hợp lại bởi truyền thống sau này do sự tương đồng trong tên gọi. Dù sao, Thất Đại Bảo Tạng được coi là một trong những kiệt tác tối thượng của Longchenpa.

Nhóm thứ hai trong danh sách của Tulku Thondup là Tam Bộ Tầm An (The Trilogy of Rest), sẽ được thảo luận chi tiết hơn ở phần sau.

Nhóm thứ ba là Tam Bộ Tự Giải Thoát Tự Nhiên (The Trilogy of Natural Freedom, Rang grol skor gsum), bao gồm ba tác phẩm: Tự Giải Thoát của Tâm Thể (The Natural Freedom of the Mind Itself, Sems nyid rang grol); Tự Giải Thoát của Pháp Tánh (The Natural Freedom of Ultimate Reality, Chos nyid rang grol); và Tự Giải Thoát của Bình Đẳng Tánh (The Natural Freedom of Equality, mNyam nyid rang grol).

Nhóm thứ tư bao gồm ba tác phẩm Longchenpa sáng tác hoặc khai mở trong Tứ Bộ Tâm Yếu của Nyingthig (The Four Parts of Nyingthig). Như đã đề cập trước đó, đây bao gồm Tinh Túy Tối Thượng của Đạo Sư (The Innermost Essence of the Master, Lama Yangtig), văn bản phụ trợ và giải thích cho Vima Nyingthig; Tinh Túy Tối Thượng của Ḍākinī (The Innermost Essence of the Ḍākinī, Khandro Yangtig), một tuyển tập các yếu chỉ về Khandro Nyingthig (mKha’ ’gro snying thig); và cuối cùng là bộ chú giải tổng hợp Tinh Túy Tối Thượng Sâu Xa (The Profound and Innermost Essence, Zabmo Yangtig). Những tác phẩm này chứa đựng sự tổng hợp của Longchenpa về phần tối mật của yếu chỉ hệ trong giáo lý Đại Viên Mãn được truyền từ Vimalamitra và Guru Rinpoche.

Nhóm cuối cùng là Tam Bộ Khuất Tán Bóng Tối (The Trilogy on the Dispelling of Darkness, Mun sel skor gsum), gồm các tài liệu chú giải về Mật điển Guhyagarbha (The Guhyagarbha Tantra), văn bản chính của Mahāyoga, lớp đầu tiên trong ba lớp Mật tông nội. Ba tác phẩm này là một bản phác thảo chung có tên Khuất Tán Bóng Tối của Tâm Thức (Dispelling the Darkness of the Mind, sPyi don yid kyi mun sel); một tóm tắt ngắn gọn Khuất Tán Bóng Tối của Vô Minh (Dispelling the Darkness of Ignorance, bsDus don ma rig mun sel); và cuối cùng là Bình Giải Khuất Tán Bóng Tối Khắp Mười Phương (Commentary That Dispels Darkness throughout the Ten Directions, ’Grel ba phyogs bcu mun sel), một tác phẩm đồ sộ hơn sáu trăm trang.